Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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