Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00269Q8N2A0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms