Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECW1Q76N89 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms