Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FBXO38Q6PIJ6 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FBXO38Q6PIJ6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms