Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHDC7AQ5VTJ3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHDC7AQ5VTJ3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms