Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms