Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms