Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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