Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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