Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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