Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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