Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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