Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VAMP3Q15836 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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