Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms