Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIP13Q15645 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIP13Q15645 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIP13Q15645 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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