Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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CHD4Q14839 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CHD4Q14839 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CHD4Q14839 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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CHD4Q14839 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CHD4Q14839 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CHD4Q14839 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CHD4Q14839 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CHD4Q14839 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CHD4Q14839 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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