Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms