Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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SHROOM2Q13796 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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SHROOM2Q13796 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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SHROOM2Q13796 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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SHROOM2Q13796 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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SHROOM2Q13796 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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SHROOM2Q13796 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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