Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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