Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1SQ13698 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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