Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNTB2Q13425 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms