Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms