Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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