Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms