Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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