Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms