Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms