Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms