Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms