Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms