Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HTD2P86397 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HTD2P86397 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HTD2P86397 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HTD2P86397 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HTD2P86397 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HTD2P86397 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms