Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMF1P82094 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMF1P82094 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMF1P82094 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMF1P82094 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMF1P82094 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMF1P82094 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms