Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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