Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ERVFC1-1P60608 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms