Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms