Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GABRA4P48169 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA4P48169 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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