Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OTX2P32243 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OTX2P32243 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OTX2P32243 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms