Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ALDH4A1P30038 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1690.9 ms