Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODC1P11926 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms