Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF1P10914 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF1P10914 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
IRF1P10914 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF1P10914 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms