Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RARBP10826 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RARBP10826 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RARBP10826 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms