Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA4P06727 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms