Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POP4O95707 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms