Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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VAPBO95292 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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