Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCATO75600 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCATO75600 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCATO75600 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms