Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms