Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTNBO60941 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTNBO60941 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms