Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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