Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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