Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRTO14522 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms